2004年10月12日，中国科学院第四次中国科大发展工作会议暨中国科学院、教育部、安徽省政府继续重点共建中国科大协议签字仪式在北京举行，对学校建设和发展具有重要指导意义。三方将以原则上不低于“985工程”一期9亿元的投入继续给予中国科大专项经费投入，进一步支持其创新平台建设、高层次人才队伍建设、基础设施建设和改造。中国科大也是首家通过签署共建协议启动实施“985工程”二期建设的高校，标志着中国科大步入一个新的发展阶段。

中国科学院第四次中国科大发展工作会议现场